全身麻醉的副作用，大致可以归结为以下几类：
首先，是因为全身麻醉有可能需要配合气管插管，插管的有创性操作，部分敏感患者在手术结束后有可能会出现声音嘶哑、喉咙肿痛的症状，一般不需要特殊处理，少量喝几次温水就能缓解，疼痛严重的可做雾化治疗。
其次，是全身麻醉对于全身生理的干扰，这其中包括各项生命体征，如血压、心率的影响，以及对于体液平衡的影响，这些基础的生命体征都会引发后续的问题。
还有，全麻过程中由于患者都是处于深催眠状态的，病人长时间保持一个体位，因此如果手术中需要特殊体位，或者患者对于长时间的平卧位也不能适应，也会引起术后头痛或者其他身体部位疼痛的情况，相对全麻出现的这些副作用基本是可逆的，因此全麻还是比较安全的麻醉方式。