真菌性鼻窦炎和霉菌性鼻窦炎是一样的。霉菌性鼻窦炎只是真菌性鼻窦炎在临床上的一种别称，因此，两种疾病并没有明显的不同。
无论是真菌性鼻窦炎或是霉菌性鼻窦炎，均指的是鼻窦部位受到了真菌感染所造成的疾病。感染的真菌种类主要有曲霉菌、毛霉菌或是念珠菌等多种致病菌。
真菌或霉菌感染鼻窦之后，患者通常会出现较为明显的鼻塞、鼻腔胀痛等症状，且在医院进行鼻内镜等检查时，可以明显地观察到鼻窦腔内有真菌球的形成。因此，此类疾病在治疗时多以手术清除真菌球及病变组织的治疗为主。