颅内的脊索瘤在极少数的情况下，有可能发生疾病的转移。这是因为脊索瘤它是一种先天性的肿瘤，这种肿瘤是属于良性肿瘤，良性肿瘤很少具有侵袭性和转移性。
但是，由于颅内的血液供应比较丰富，因此极少数的颅内脊索瘤有可能会通过直接蔓延的方式，或者是血行播散的途径发生疾病的转移。脊索瘤临床上主要表现为一些头痛的症状以及颅神经受损的表现，到了晚期很多患者会多个颅神经受损，表现为相应的症状。
对于脊索瘤的治疗，主要是以手术治疗为主，术后有的患者需要补充放射治疗，而脊索瘤对于放射治疗的疗效还是较好。脊索瘤总体的肿瘤进展速度比较慢，患者可以生存较长的时间，预后较好。