肛门疼痛有可能是肛裂引起的。排便时神经末梢受到刺激引起肛门内括约肌痉挛收缩造成肛门狭窄，大便撑破肛门导致持续性疼痛。肛门疼痛还可以见于于血栓痔、炎性外痔、肛周脓肿等疾病。
建议这种情况可以来医院肛肠外科进行当面就诊检查，明确诊断。可以外用马应龙麝香痔疮软膏、灭活埃希的松乳膏等进行涂抹肛门，应用高锰酸钾溶液或者苦参汤等进行温水坐浴熏洗肛门。
如果疼痛严重，可以来医院肛肠外科进行物理红光治疗，促进炎症吸收以消炎止痛，必要时可以考虑手术治疗。