排便后肛门有疼痛感，首先是考虑肛裂的情况。排便以后肛门出现疼痛，最常见的原因就是肛裂，是由于粪便的刺激，肛裂裂口受到摩擦而出现了疼痛。特别是一些间歇性疼痛的情况，就是排便时会有疼痛，排便以后会有一个短暂的缓解期。在缓解期过后，会再次出现疼痛，是肛裂典型的疼痛的特点。
其次，排便以后肛门有疼痛，也得排除是不是肛门局部有感染的情况，比如皮脂腺或者是毛囊发生了感染。在粪便的刺激下可以出现疼痛，肛门周围间隙内的脓肿，在粪便的刺激下，也可以出现疼痛的情况。
另外，肛内增生性的疾病，比如息肉或者是肿瘤组织脱出到肛门外，回纳不及时也会有疼痛的发生。