肝囊肿可以出现在肝脏的任何部位，既可以出现在左肝，也可以出现在右肝。
肝囊肿产生的原因大多是先天性发育异常所致，因胚胎时期胆管发育异常，造成肝内小胆管闭塞，常多发，伴有多囊肾。小部分肝囊肿由创伤、炎症、结石等堵塞小胆管所致，常单发。
如果囊肿出现在左肝，可能是胚胎发育时期左侧的肝内小胆管出现闭塞，或者是创伤、炎症或结石堵塞了左侧的肝管。无论是囊肿发生在左肝还是右肝，治疗原则都是相同的。