继发性癫痫发作后出现头痛，首先要分析是什么原因引起，然后进行治疗。
有可能是癫痫发作后引起脑细胞缺血、缺氧，导致高颅压引起头痛，可以应用一些降颅压的药物，常用的有甘露醇、呋塞米和甘油果糖。同时应用一些营养神经的药物，也可能会缓解患者的症状，常用的有奥拉西坦、吡拉西坦和胞磷胆碱。
如果是由于原发病导致患者出现头痛时，应积极地治疗原发病。比如低血糖患者可以出现，应及时地调控血糖，可以口服糖水、糖盐水以及巧克力，必要时静脉推注高渗葡萄糖。如果有脑血管疾病引起，主要是积极治疗脑血管疾病等。