肛瘘手术成功与否的关键在于是否能准确的找到内口并将其处理好。肛瘘分为低位单纯性肛瘘、低位复杂性肛瘘、高位单纯性肛瘘、高位复杂性肛瘘。
其中低位单纯性肛瘘和高位单纯性肛瘘因内口、瘘管及外口只有一个，术中内口应该很好找到，处理起来比较简单，术后不会复发。
但复杂性肛瘘因外口及瘘管可能有两个或两个以上，这种情况下寻找内口可能比较困难，有时不能将其准确定位，术后容易复发。所以在处理复杂性肛瘘时，可先进行瘘管造影，以明确瘘管的走向及内口的位置，这样才能提高手术的准确性。