预防克山病，需要有健康的生活方式、生活环境卫生。饮食习惯健康合理，低盐饮食，防止偏食。尤其是妇女和儿童，避免过热、过冷、过劳和暴饮、暴食、吸烟、酗酒，以及情绪大起大落等。
还需要改善机体的健康状态，如肠道和呼吸道感染会增加患克山病的概率，故应该预防感冒，食物不应刺激或难消化。非高发地区人员应该避免在高发地区停留，高发地区人群应该补充适当的硒元素。如可以口服亚硒酸钠溶液等，以此减轻对心肌的损害。
定期体检，早发现、早治疗。