半夜心口窝疼常见于心血管疾病，比如心脏疾病，尤其是冠心病。
冠状动脉主要为心脏供血、供氧，睡觉时若是冠状动脉出现堵塞或痉挛，就会影响正常的血流供应，或者出现急性心梗，容易导致心肌供血缺乏，诱发心绞痛发作，此时就会感觉到心口窝出现疼痛，有的患者可能会感觉到左侧胸部痛。
也有可能是消化系统疾病而造成，比如晚上吃饭时暴饮暴食或者吃太多寒凉的东西，可能会诱发胃溃疡或者胃炎，通常也会夜间出现心口窝疼痛。