引起继发性肾上腺皮质功能不全的原因，主要是因为垂体或者是下丘脑的病变，出现了ACTH的分泌不足，从而导致肾上腺皮质、皮质醇分泌的不足等等所导致。
因此常见的疾病主要是下丘脑的疾病，或者是垂体的疾病。可以有垂体的肿瘤、垂体的缺血坏死，还可以是垂体的感染性的疾病，比如说脑膜炎、脑炎、流行性出血热等等，感染到垂体也可以引起。
除此以外像医源性的因素，垂体瘤手术以后，或者是放射治疗以后，可能也会出现垂体的功能减退，还有垂体卒中、垂体的浸润性疾病等等。
另外像下丘脑的疾病，比如说像下丘脑的肿瘤、下丘脑一些浸润性的疾病，还有像垂体柄的损伤，都可能会导致腺垂体功能减退，继而引起肾上腺皮质功能不全。