酵素的副作用有食物中毒的表现，如腹痛、腹泻等，还可能会出现甲醇中毒的表现，头昏、心慌、看东西模糊等。
酵素都是用谷类作为原料，然后经乳酸菌或酵母发酵制成的食品，主要的功效包括平衡肠道菌群、改善人体新陈代谢、排毒养颜等。
酵素的有益作用来源于酵素中的活性成分，如黄酮类、植物色素、超氧化物歧化酶等，可以帮助清除自由基。
酵素的本质就是酶，而酶多是由蛋白质组成的，蛋白质进入人体后会经消化道分解成氨基酸，之后氨基酸会再重新组成蛋白质再利用。