雌激素低首先会影响月经周期，引起月经紊乱或者经血量减少，严重的甚至会导致闭经等情况，引起女性出现不孕。
青春发育期少女，如果雌激素分泌量低，还有影响生殖器官发育，导致子宫发育不良，影响乳房发育等。生育期妇女如果雌激素分泌不足，雌激素低还会引起月经失调影响卵泡发育，导致卵泡不能发育成熟排出卵子影响怀孕。
其次，孕妇如果雌激素分泌量不足，还会引起流产等，女性雌激素低，还会影响身体对钙的吸收，导致骨质疏松等情况，影响女性身体健康。