患有肾结石出现了左侧腰部隐隐作痛，可能是左肾结石引起的上尿路感染，病原体在肾内大量繁殖，同时释放内毒素、炎症介质因子，会引起肾脏血管扩张、渗出，从而导致左侧肾区隐痛。
肾结石移位堵塞了肾盂输尿管开口处或肾盏颈，引起肾盂、肾盏积水，肾内张力过大，尿液通过淋巴管逆流至肾实质，会引起肾脏水肿、肾包膜张力过大，牵拉包膜神经，从而导致左侧腰部隐隐作痛。
结石移位对肾盏黏膜以及肾盂黏膜的摩擦刺激，引起局部黏膜下平滑肌痉挛性收缩，也会引起疼痛不适。