输卵管堵塞是没有明显的治疗效果的，可以通过腹腔镜手术治疗。若子宫内膜异位症引起的痛经，可以口服避孕药缓解疼痛。
若因急性盆腔炎导致的输卵管堵塞，可以口服抗生素来治疗急性盆腔炎，从而改善堵塞情况。若输卵管伞端粘连，建议做输卵管伞端造口术，输卵管轻度的粘连，建议可以做输卵管通液术，配合中药治疗。
输卵管堵塞的治疗不是通过药物来解决的，而是通过手术和试管的方法来解决的。如果是输卵管的严重堵塞，输卵管疏通术也无法缓解堵塞，从而难以怀孕，建议做试管婴儿。