生殖器疱疹如果不进行治疗，可能会自行消退，一般需要一周左右，但此病通常很容易复发。当然，如果不治疗也可能会引起局部疱疹部位的皮肤发生糜烂破溃的现象更加明显，算是比较轻微的结果。
而严重的情况下，患者皮肤出现破溃的同时又没有注意及时预防感染，造成继发性的细菌感染出现，局部皮肤破溃流脓，甚至能够造成全身性的脓毒血症的发生，比如会出现患者精神萎靡不振、头晕头痛的现象以及关节疼痛、发热等情况。
所以针对生殖器疱疹，还是应该建议积极的抗病毒，以及免疫调节的治疗，口服伐昔洛韦、泛昔洛韦片，外用干扰素凝胶、酞丁安软膏等。注意休息，增强营养，加强外生殖器的清洁护理。