保守治疗肠瘘痊愈的时间和肠瘘发生部位有直接的关系，和肠瘘瘘口的大小和肠瘘类型也有关，而且痊愈时间个体差异比较大。
首先，如果肠瘘发生于近端小肠，由于小肠瘘瘘出液比较多而且瘘出的消化液腐蚀性比较强。所以其愈合时间是最久的，经积极的保守治疗，一般都需要2~3个月以上才可以痊愈。
其次，如果肠瘘发生于远端小肠或者结肠，漏出液的量相对偏少，经积极保守治疗，痊愈大约需要1个月以上的时间。
最后，肠瘘类型对痊愈时间影响也非常大，例如痊愈时间最短的为管状瘘，而唇状瘘及完全瘘愈合的可能性相对比较低，大多需要进行手术治疗。