睡觉时感觉呼吸困难的原因要具体分析，此类患者多是由心肺相关疾病引起。例如，哮喘患者多于晚间好发或是急性加重，此时可以在睡觉时诱发其出现喘闷甚至呼吸困难。哮喘患者要完善肺功能加支气管舒张试验、呼出气一氧化氮测定等。
心力衰竭患者亦可以引起晚间睡觉呼吸困难，严重患者可以发生心源性哮喘。要完善心脏彩超、心电图、血BNP等检查。
少数患者睡觉时感觉呼吸困难有可能是植物神经功能紊乱，特别是那些有失眠、抑郁、焦虑的患者，有时还会发生过度通气综合征。
还有部分睡眠呼吸暂停综合征患者因晚间睡觉出现低通气、憋醒等，自我感觉有呼吸困难。