甲状腺肿瘤的原因并不十分清楚，考虑可能与甲状腺癌发病有关的病因，可以分为细胞生长分化的刺激因素和细胞生长分化的突变因素。这两种因素单独或者共同作用于甲状腺细胞，使其由正常的细胞转变成了肿瘤细胞。主要的原因：
第一个放射性的照射。主要是头颈部、或者上纵隔放射治疗或者人群暴露等这些情况，增加了甲状腺癌的发病率。
再一个就是碘的摄入量增加，可能也与这种疾病的发病有关系。
还有就是内分泌激素的异常，像生长激素瘤，可能会同时合并有甲状腺的肿瘤。
除此以外，甲状腺肿瘤这种疾病，还有家庭的聚集倾向，所以，有家族遗传的可能性。