耳朵里面如果出现了黑霉菌，可以通过冲洗耳道、局部涂抹药物或者是口服药物的方式来治疗。
患者可以到医院的耳鼻喉科就诊，遵医嘱使用生理盐水等对耳道进行清洗，将附着在耳道粘膜表面的黑霉菌清理出来。之后可以选择局部使用的抗菌类的滴耳液滴入耳道内，或者是使用克霉唑等抗真菌的软膏涂抹在耳道内有黑色霉菌的皮肤表面，进行抗菌治疗。
如果耳道内的黑霉菌仍然不能有效清除，患者还可以口服抗菌药物，进行全身性的抗菌治疗，平时应该注意保持外耳道的干净清洁。