外耳道的真菌感染治疗主要是采取抗真菌药物，用复方两性霉素B眼药水滴耳。每晚睡前涂达克宁软膏或制霉菌素软膏，可以对真菌性外耳道炎有效的治疗。如果存在鼓室穿孔，最好是痊愈后进行鼓室成形术根治。
另外，霉菌感染外耳道的患者请注意，平时不要用太硬的东西去掏耳朵。一来在掏耳朵的时候会因为触碰而导致疼痛，二来是因为用硬的东西掏耳朵很容易划伤外耳道皮肤。
形成细微的伤口，容易加重感染。被霉菌感染耳朵的朋友在清洁耳朵的时候，最好使用干净的柔软的棉签。