孕妇查出右侧膈疝有可能是先天性的，也有可能是后天创伤性的。膈肌是分隔胸腹间的一层肌性与腱性结构相移行的薄膜组织，本身就比较薄。
先天性的原因是由于人体胚胎在第4~8周横隔发育时期的时候，发育停顿造成了横膈缺损所导致的，与基因、综合病症、染色体的异常有一定的关系。
后天获得的创伤性膈疝，可以因为直接的损伤或者是间接的暴力，或者是胸腹腔内压力突然改变而损伤膈肌，导致膈肌破裂而形成的，比如刀刺伤、枪弹伤、爆震伤、挤压伤、坠伤等。只是可能比较轻微，没有什么异常的表现，所以只是在孕期检查的时候才发现。