黄芪汤对于治疗扁平疣有一定的作用，但是效果如何，需要根据个人的体质及其疾病的严重程度而定。
黄芪汤用于口服治疗扁平疣，主要是因为黄芪具有清热解毒的效果，但是中成药见效都比较的慢。
扁平疣大多数是由于人体抵抗力低的时候，由于病毒感染而引起来的赘生物，临床上主要选择物理治疗，比如激光治疗和液氮冷冻治疗。同时需要提高免疫力治疗，可以吃一些提高免疫力的药物，比如复方甘草酸苷胶囊。黄芪汤具有清热解毒的作用，可以起到一定的抗病毒的效果，但是需要长久的使用。