肛瘘一般术后1~2天后就可以开始正常排便，术后24~48小时之内应该控制排便。所以，在术后早期应该以流质或者半流质饮食为主，避免术后早期排便而刺激手术切口引发疼痛、出血等并发症状。
也需要结合患者具体手术方式以及创伤的大小。对于一些复杂性肛瘘的术后患者，如果局部切口进行缝合，控制排便时间应该延长，可能需要术后3~5天才能正常排便。因为肛瘘术后的缝合切口早期排便有可能会污染切口，从而造成切口出现感染、愈合不良等。
患者恢复正常排便后，在每次便后需要注意手术切口的清洁与消毒，避免粪便等感染物质积存在切口内而影响切口的愈合。