桥本氏甲状腺炎又称慢性淋巴细胞性甲状腺炎是自身免疫性甲状腺炎中最常见的类型。是因为产生自身抗体破坏了甲状腺组织所导致。该病是原发性甲状腺功能减退症的最常见原因。但是桥本甲状腺炎并不等同于甲减。一方面，桥本氏甲状腺炎由于甲状腺组织被破坏，最终多进展为甲状腺功能减退，但可出现甲功正常、甲亢等表现，部分患者甲亢与甲减交替存在，少数患者甲减可自行缓解。
所以桥本甲状腺炎并不一定表现为甲减。而甲减也不一定都是由桥本甲状腺炎造成的，甲减的病因包括原发性甲减、继发性甲减以及周围性甲减三类。约99%的甲减都是原发性甲减。原发性甲减中自身免疫性甲状腺炎、甲状腺手术和甲状腺碘131治疗三大原因占了90%以上。所以桥本甲状腺炎可以说是绝大多数甲减的病因。