红细胞计数是临床上用于判断红细胞疾病的一个很重要的指标。
如果红细胞计数超过正常值上限，可能是长期缺氧或血液浓缩等情况引起继发性红细胞增高，也可能是由于慢性骨髓增殖性疾病中的真性红细胞增多症导致。如果红细胞计数低于正常值下限，称为贫血，可以根据红细胞计数下降的程度，将贫血分为轻度、中度和重度。重度贫血往往是血液科的急症，需要及时救治。
另外，红细胞计数还可以作为某些疾病的疗效观察指标，如上消化道出血，如果红细胞计数进行性下降，多考虑仍有活动性出血。