囊肿性输卵管堵塞及时的治疗也是好治的，但也需要看具体的严重程度。如果急性输卵管堵塞直径比较小，可以在医生指导下口服活血化瘀的药物，促进囊肿吸收进行保守治疗。但如果囊肿比较大或者是经过治疗之后没有好转，长期不怀孕，建议最好去医院手术治疗。
可以通过囊肿切除术治疗，一般建议在腹腔镜下手术，术后只要输卵管恢复通畅后就可以正常的怀孕。如果是输卵管黏连导致的积水、积脓，建议做输卵管切除术，保留一侧健康的输卵管也是可以怀孕的。