眼眶囊肿的治疗，主要是手术完整摘除，包括囊壁一起完整去除。注意勿使囊壁残留，以免复发。浅层的囊肿手术多数比较简单，眶深部的皮样囊肿或者眼眶囊肿，常常需要做外侧开眶术，残留囊壁，需要用石碳酸腐蚀后冲洗。
眼眶囊肿多位于骨缝附近，尤其好发于眼眶外上边缘，多在青少年发病，触诊可以摸及表面光滑、有弹性的球形隆起，难以推动。
少数骑跨于眶内外，与骨缝相连接，呈哑铃状外观。B超可见高回声的囊壁内有液性暗区，ct可以显示病灶处眶骨凹陷、扩大。