膝关节软骨瘤形成的真正确切原因，目前还并不是十分明确，一般考虑和两个因素有关。
一个因素，就是在胚胎生长发育期间，出现染色体的改变，也就是基因的突变，从而造成中胚层的软骨生长发育异常，导致软骨瘤。
另一个因素，就是考虑在软骨的生发过程中，由于不良因素刺激，导致软骨的生发障碍、生发异常、分化异常等原因，导致的膝关节软骨瘤。
软骨瘤一般分为内生性软骨瘤和向外生长的软骨瘤。内生软骨瘤又分为单发性的内生软骨瘤，以及多发性的内生软骨瘤病。向外生长的软骨瘤，一般称之为骨膜软骨瘤。骨膜软骨瘤好发于长骨的干骺端，而内生性软骨瘤常好发于手足的短骨。另外，还有一种软骨发育异常以及血管瘤综合征，也会出现全身多发的软骨瘤。