儿童五更泄可以通过温阳健脾、止泻的药物进行针对性治疗，患儿出现肠鸣音亢进、脐部疼痛、在黎明前出现泄泻、泻后痛减、大便稀薄、混杂、不易消化食物、身体形寒肢冷、四肢不温，疲劳乏力、小便清长、舌质胖、有齿痕等脾肾阳虚的症状。
可通过温阳散寒的药物治疗，比如：四神丸、金匮肾气丸、附子理中丸等药物，配合神阙穴贴敷中药，艾灸、神阙、关元、气海、天枢、足三里、肾俞、脾俞等穴位。
同时饮食宜清淡，避免辛辣、油腻、寒凉、生冷等刺激性食物，适度多晒太阳及运动，避免受寒着凉等治疗效果很好。