胰腺结核是有可能复发的。由于患者没有早期进行治疗或者是没有合理的、足量的疗程抗结核化学药物治疗，部分患者在身体抵抗力下降的时候，就有可能会导致结核的复发。
所以，一般胰腺结核建议尽早地手术治疗，并且辅助抗结核化学药物的治疗。其原则要遵循早期、规律、全程、适量、联合的原则。也必须联合异烟肼和利福平，建议使用四联用药。整个治疗方案分为强化和巩固两个阶段进行，采取全程的监督化疗的管理，以保证患者不间断地规律用药。
此外在治疗中要防止获得性耐药变异菌的出现，是保证治疗成功的重要措施。患者在日常生活中也应该养成良好的作息习惯，注重多加休息，加强营养支持。