小儿幽门肥厚不建议进行保守治疗，因为保守治疗对于症状没有很好的缓解作用。并且如果长时间的不治疗，可能会影响小儿的消化，甚至导致小儿出现营养不良，从而降低小儿的抵抗力，甚至会引发其他多种疾病，所以，不建议进行保守治疗。
目前治疗小儿幽门肥厚最佳的手段为手术治疗，也可以在医生指导下选择微创手术。
在术后要注意小儿的护理，尽快地缓解宝宝的症状，达到康复的状态。小儿幽门肥厚多见于六个月内的宝宝，临床症状以吐奶、呛奶、体重减轻为主。