小儿幽门肥厚能不能够打疫苗，要根据孩子的身体状况来综合判断分析。如果孩子的身体各项指标都是属于正常的，这种情况可以打疫苗。
另外，如果孩子确诊有幽门肥厚以后，应该要及时地在医生的指导下进行相应的治疗。如果有手术指征可以尽快通过手术进行治疗，以免耽误最佳治疗时机，在手术之后等孩子身体恢复好了再打疫苗。
如果孩子身体比较虚弱，这种情况下是不建议打疫苗的。在生活当中孩子多晒晒太阳促进钙吸收，提高自身的抵抗力。