肺孢子菌病是机会性肺部感染，主要发生于免疫功能下降的患者。常见于以下高危人群：艾滋病的患者、早产儿、婴幼儿、营养不良的儿童、老年患者、器官移植、肿瘤以及长期口服糖皮质激素、免疫抑制剂的患者，这些患者多是肺孢子菌病的好发人群。
肺孢子菌病的传染源主要在于肺孢子菌带菌的患者以及肺孢子菌肺炎的患者。其传播主要是通过空气飞沫传播，当此些高危人群吸入含有肺孢子菌的飞沫以后，在肺部产生炎症反应，从而导致肺孢子菌肺炎的形成。
肺孢子菌肺炎患者多见于免疫功能受到明显抑制的患者才容易发病，患者可以出现刺激性的咳嗽，逐渐出现呼吸困难以及伴有发热的症状。