牙根尖囊肿是否会影响旁边的牙，与具体情况有关。
如果囊肿产生时间不长，机体免疫力较强，根尖囊肿的直径约1~2cm，范围局限，不会影响旁边的牙齿。对囊肿涉及的病灶牙进行根管治疗，局麻下彻底摘除根尖囊肿就可以治愈。
如果根尖囊肿的直径大于2cm，病变扩展速度较快，造成牙槽骨重度吸收，会使邻牙根尖孔的闭合功能受到损伤，并使邻牙出现不同程度的松动，干扰咀嚼和进食。需要尽早拔除病灶牙，将囊肿与囊壁完全摘除。必要时填塞骨粉，促进新生骨质形成。