扁桃体出现了反复发炎的表现后，在急性发炎期，可以选择青霉素类的抗生素药物，例如阿莫西林来进行治疗。是因为造成扁桃体发炎的病原体一般是以革兰阳性球菌等致病菌为主的，而青霉素对此类病菌的杀灭效果较好。
但需考虑的是，部分患者可能存在对青霉素过敏的情况，如果用药前皮试结果显示有过敏可能，则建议选择头孢类的抗生素药物来作为替代。
如果患者扁桃体的反复发炎症状在1年内大于3~5次以上，甚至有明显的扁桃体增大的表现，则单独使用药物可能无法治愈，可考虑手术切除扁桃体。