卵巢囊肿治好了很多还是会再复发的，尤其是卵巢巧克力囊肿的复发率是非常高的。因为卵巢囊肿手术是行卵巢囊肿的剥除，保留正常的卵巢组织，卵巢重建，慢慢的长出一个完整的卵巢，有一些在一定的时期内又会重新长出囊肿。
卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位到卵巢内生长繁殖而形成的，子宫内膜的繁殖能力特别强，巧克力囊肿剥除以后，复发率特别高。
所以，如果做了卵巢巧克力囊肿手术，术后一定要进行长期管理，一般要辅助药物治疗3到6个月，防止复发，一般会选择GnRH-a进行治疗，抑制异位内膜的生长，而减少复发的几率。