喝酒一般不会引起肠穿孔。经常大量喝酒有可能会导致胃部黏膜受到刺激损伤，形成溃疡面，导致胃溃疡、十二指肠溃疡的发生，溃疡面越来越大，损伤肌层容易引起胃穿孔。
而引起肠穿孔一般考虑是肠道炎性疾病，比如最常见的是溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核等，由于炎症的反复刺激，肠道黏膜形成糜烂、溃疡，最后导致肠穿孔，肠道内的内容物进入到腹腔后，引起腹部疼痛、腹膜炎等。
肠道梗阻比如存在直肠癌、结肠癌，肠道内的粪便无法通过，导致肠道内的压力过大，也可诱发肠穿孔。