打喷嚏时小肚子疼，可能是打喷嚏时比较急，而且过于用力，腹肌也会随之剧烈收缩，从而导致小腹壁的肌肉拉伤，因此可出现小肚子疼的现象。
另外，如果在打喷嚏的同时，膀胱正处于充盈的状态中，如果打喷嚏突然增大腹腔压力，膀胱壁也有可能会因此而受损，进而引起小肚子疼痛。另外，这种情况也有可能与腹部病变有关，比如阑尾炎。如果突然打喷嚏或者跳跃，也有可能会引起小腹疼痛。若疼痛情况较为剧烈，需要尽快就诊。
此外还要注意，打喷嚏容易导致一些并发症，特别是高血压患者，打喷嚏时一定要控制好幅度，避免引起脑出血。