化脓性扁桃体炎并不会引起感冒，部分感冒的患者会继发化脓性扁桃体炎。虽然化脓性扁桃体炎和感冒都属于上呼吸道感染，但两者还是有一定的不同。
感冒多是病毒感染上呼吸道引起，此时患者多是以上呼吸道的卡他症状为主，例如鼻塞、流鼻涕、打喷嚏、咽喉疼痛，偶有低热不适。化脓性扁桃体炎由细菌感染扁桃体所引起的，两者不能混淆一起。部分病毒性感冒如果未及时、有效地治疗，可以继发细菌性感冒而有化脓性扁桃体炎的并发症形成。
感冒多是因受凉或是被其他的感冒患者传染而患病，故当有上呼吸道感染时要区分是感冒，还是化脓性扁桃体炎。