小儿肾积水对肾脏是有一定损伤的。
首先小儿肾积水容易导致肾脏出现萎缩现象，因为肾积水会造成肾脏功能的障碍，导致尿液排出受阻，肾盂逐渐膨胀、扩大，肾脏内的压力增大，肾脏血管受压血液循环障碍，肾脏因供血供养不足而出现萎缩现象。如果是轻度的肾萎缩及时的进行治疗，解除梗阻受压后会逐渐恢复到正常。如果是重度的肾萎缩，肾功能严重受损害不可逆转的，难以修复。
另外，小儿严重的肾积水还可能会导致肾脏破裂，出现急性腹膜炎症状，甚至会危及患儿生命。