儿童肾炎有先天性的也有后天性的。
先天性的肾炎包括薄肾小球基底膜病、家族性出血性肾炎等，这些疾病导致的肾炎和遗传有关，属于基因缺陷导致的。薄肾小球基底膜病的病理变化为弥漫性的肾小球基底膜变薄为主，家族性出血性肾炎的病理改变为肾小球基底膜的广泛便后破裂为主，二者都可以表现为肾炎，儿童期既可以有肾炎的表现。
大部分肾炎都是后天形成的，发病的原因和呼吸道链球菌感染有关，链球菌感染后激发体内的免疫应答损伤导致肾脏出现肾炎。