儿童肾炎有可能是遗传的。目前导致儿童出现肾炎的因素并不明确，有可能和遗传有关系，遗传性肾炎的患儿多携带突变基因。
其次，肾炎的发生和病毒、细菌感染有关，大部分儿童肾炎有上呼吸道感染的病史，比如扁桃体发炎，所以认为儿童肾炎的发生和感染有关。也有可能是由于服用对肾脏损伤比较大的药物引起肾炎，比如私自滥用抗生素，大量服用镇痛药等。
也有可能是由于自身免疫紊乱引起。儿童肾炎是由于多种病因所引起的一种疾病，大多数类型的肾炎需要长期治疗，甚至需要终身治疗。