腮腺炎的治疗方法根据不同类型而有所不同。
化脓性腮腺炎以对因治疗为主，青霉素或者是一代、二代的头孢都有较好的效果。若效果都不佳，可以在腮腺处取脓液进行细菌培养做药敏试验，选用合适的药物进行治疗。当药物无效时，出现患处局部波动感，可以去医院行切开引流。
流行性腮腺炎则对症治疗，以休息、隔离为主，可以尝试使用抗病毒类药物。光疗也有一定的效果，如氦氖激光和红光照射。需要注意的是，若为男性患者。则应在刚确诊时就服用己烯雌酚，来避免出现睾丸炎。