连花清瘟颗粒服用后，也有可能会引起拉肚子。
本品组方药物成分较多，全方的药性偏寒。因此，有的患者服用后，可能对药物不耐受。或者本身的肠胃较为虚弱，这就容易引起胃部不适或一些肠道反应。特别是脾胃虚弱者，不宜服用本药物，否则更容易引起腹痛、腹泻、体虚等多种不良症状。
服用连花清瘟颗粒后，有腹泻情况的患者，建议应先暂停服药，观察腹泻症状是否有所好转。建议要就医检查，确诊腹泻的具体病因。如有必要，需要在医生的指导下改换其他药物治疗。