起床会咳嗽可能与呼吸道内有痰液有关，咳嗽的目的在于清除呼吸道分泌物以及排出异物。
当夜间痰液在呼吸道内积聚后，起床时因为痰液的流动就会对呼吸道黏膜造成刺激，从而就会产生咳嗽，促使痰液的排出，这也是一种条件反射。
对于反复出现的咳嗽现象，可以根据痰液的颜色以及痰液的黏稠度进行分析，必要时可以进行胸部的X光检查以及血常规检查，明确一下病变的部位以及了解病变的程度。对于痰液比较多的现象，可以通过服用稀释痰液，促进痰液排出的药物治疗缓解。