身上肌肉疼可发生于急性的感染，或肌肉劳损损伤后造成的疼痛，多以肢体部位、颈肩及腰背部为主。部分患有原发性骨质疏松的患者，也会造成腰部腰椎出现压缩性骨折，及肌肉痉挛后造成疼痛，需要积极查找诊断病因后进行干预治疗。
腰背部位出现的疼痛多以局部慢性劳损伤害有关，如竖脊肌、胸腰筋膜及菱形肌等，在长时间的重力劳动后诱发劳损伤害引起疼痛。另外，伴有遗传性的肌肉疾病也会造成肌肉疼痛，如线粒体肌病。
其他原因，遭到感染登革热、回归热、流感及出血热等疾病，也会造成身体肌肉出现疼痛。