同房时龟头疼痛，可能存在以下几种原因：
1.龟头包皮炎症。患有龟头包皮炎症时，同时在性生活过程中可能加重局部炎症充血，导致龟头疼痛。
2.包皮嵌顿。对于一些本身有包茎，或者包皮过长，伴有包皮狭窄环的男性，性生活时可能会出现包皮嵌顿，这时可能会导致龟头部位血流不畅而出现疼痛。
3.包皮系带损伤或断裂。性生活过程中可能会因为用力过猛导致系带损伤，甚至系带断裂，导致龟头及系带部位疼痛的发生。另外，如果本身有尿道炎症，也可能会导致性生活龟头部位的疼痛。