同房时阴茎痛可能是性生活频繁导致的，也不排除是包皮过长、精囊炎、龟头炎、阴茎炎等原因引起的，可以根据引起的原因进行治疗。
1.同房频繁。
如果同房时间较长且频率过高，可能会导致阴茎的海绵体充血，引起疼痛的症状。这种情况一般不需要特殊治疗，可以通过休息和降低同房频率的方式改善。
2.包皮过长。
包皮过长一般指阴茎在自然的状态下无法外露或少部分外露的情况，如果勃起后能完全外露，且能顺利同房就不用特殊处理。如果经常出现包皮感染，水肿疼痛等症状，同房症状加重，可以在医院通过手法复位、传统包皮环切术等方式辅助缓解。
3.精囊炎。
精囊炎可能是会阴部损伤、细菌感染等原因引起的，导致会阴胀痛、射精疼痛等症状。患者要保持充分的休息，避免过度劳累，而且可以遵医嘱使用利福平胶囊、异烟肼片、罗红霉素胶囊等药物辅助改善。
4.龟头炎。
该疾病常常是卫生条件差、微生物感染等原因导致的，出现龟头红肿、糜烂等症状，并且可能伴随局部瘙痒、疼痛等症状。可以在医生指导下使用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏、克霉唑乳膏等药物缓解不适症状。
5.阴茎炎。
阴茎损伤、接触刺激物品等原因可能诱发该疾病，导致阴茎部位疼痛、尿痛等症状。可以遵医嘱使用阿奇霉素片、盐酸左氧氟沙星胶囊、红霉素软膏等药物进行治疗。
在日常生活中，要注意保持阴茎部位的卫生，洗澡的时候注意用清水清洗。