腋下囊肿是否会自己消失，一般需要依据自身的恢复能力、腋下囊肿的大小、是否合并感染等实际情况，进行综合的分析。
1.如果腋下囊肿的体积比较小，而且没有出现细菌等感染，自身体质较好，一般这种情况下，囊肿可能会被逐渐吸收然后消失。
2.如果腋下囊肿的体积较大，并且有细菌等感染，如有腋下囊肿处的皮肤红肿、疼痛等，此种情况腋下囊肿一般不会被完全吸收。如果自身抵抗力较弱，甚至出现破溃等情况，建议及时去医院就诊，根据囊肿情况采取抗菌药物或局部切开等方式治疗。